執行一科、執行二科及執行三科掌理事項如下：
一、公法上金錢給付義務之強制執行、協調及聯繫。
二、公法上金錢給付義務強制執行事件之監督及審核。
三、公法上金錢給付義務強制執行事件聲明異議之審議及處理。
四、公法上金錢給付義務強制執行事件拘提、管收之聲請及執行。
五、其他有關公法上金錢給付義務強制執行事項。

秘書室掌理事項如下：

一、本分署有關行政執行法規及司法行政事務之審議事項

二、行政執行法規資料之蒐集、整理、研究及編譯事項

三、施政報告及工作報告之編擬事項。

四、綜合計畫與研究發展、公文管制與稽催、為民服務工作之規劃、督導與考核及其他管制考核事項

五、印信典守事項。

六、現金、票據、有價證券之管理及出納事項。

七、工友及技工之管理事項。

八、財產、物品管理及宿舍維護事項。

九、辦公室維護、營繕及採購案件之辦理事項。

十、本分署會議各項議事相關資料準備、簽報及紀錄事項。

十一、公文之收發、繕校、檔案管理及文件資料之印製事項。

十二、上級交辦及不屬於其他各科、室之事項。

人事室:
人事室或人事管理員掌理嘉義分署人事事項。

政風室:
政風室掌理嘉義分署政風事項。
未設政風室者，其政風業務由分署指定人員兼辦，並受行政執行署政風室指導。

會計室:
會計室或會計員掌理嘉義分署歲計及會計事項。

統計室:
統計室或統計員掌理嘉義分署統計事項。

嘉義分署處理業務，實施分層負責制度，依分層負責明細表逐級授權決定。